RNA-seq (RNA dizileme), bir hücrenin veya organizmanın genetik materyali olan RNA'nın yüksek çözünürlüklü bir şekilde dizilenmesini sağlayan bir biyoteknolojik tekniktir. Bu yöntem, hücredeki tüm RNA moleküllerini (mRNA, tRNA, rRNA, vb.) belirleyerek, gen ekspresyonunu ölçer ve hangi genlerin aktif olduğunu, hangi koşullar altında bu genlerin ifade edildiğini ortaya koyar.
RNA-seq, genetik ve moleküler biyoloji alanlarında devrim yaratmış bir tekniktir çünkü diğer geleneksel yöntemlerin aksine çok daha hassas ve kapsamlı sonuçlar sunar. Bu teknoloji, genetik hastalıkların, kanser araştırmalarının, ilaç geliştirme süreçlerinin ve hücresel süreçlerin anlaşılmasında önemli bir rol oynamaktadır.
Diferansiyel gen ekspresyonu, farklı koşullar altında genlerin ne kadar aktif olduğunu karşılaştıran bir biyoinformatik analiz yöntemidir. Biyolojik sistemlerdeki değişimlerin anlaşılması için genetik materyalin incelenmesi büyük önem taşır. Örneğin, bir hastalık durumu ile sağlıklı bir durum arasındaki gen ekspresyon farklarını incelemek, hastalıkların mekanizmalarını anlamamıza yardımcı olabilir. Diferansiyel gen ekspresyonu analizi, genellikle RNA-seq (RNA dizileme) verileriyle yapılır ve bu sayede genlerin aktiviteleri detaylı bir şekilde ölçülür.
Transkriptomik, bir organizmanın veya hücrenin tüm RNA profilini inceleyen bir araştırma alanıdır. RNA dizileme (RNA-seq), bu alandaki en yaygın ve güçlü yöntemdir. Transkriptomik analiz, hücrede hangi genlerin aktif olduğunu, hangi süreçlerin tetiklendiğini ve çevresel veya biyolojik faktörlerin gen ekspresyonunu nasıl etkilediğini anlamamıza yardımcı olur. Bu bilgiler, kanser gibi hastalıkların daha iyi anlaşılması ve tedavi stratejilerinin geliştirilmesi açısından son derece değerlidir.
R, biyoinformatik ve genetik araştırmalarda yaygın olarak kullanılan güçlü bir programlama dilidir. RNA-seq verilerinin analizi için R dilinde pek çok araç ve paket bulunur. Diferansiyel gen ekspresyonu analizi yapmak için en yaygın kullanılan araçlardan biri DESeq2'dir. DESeq2, RNA-seq verilerini analiz etmek ve farklı koşullar altındaki gen ekspresyonunu karşılaştırmak için kullanılan bir R paketidir. DESeq2, şunları yapmamıza olanak tanır:
- Veri Normalizasyonu: RNA-seq verilerinin farklı örnekler arasında karşılaştırılabilir hale gelmesi için normalizasyon yapılır.
- Diferansiyel Analiz: Farklı koşullar altındaki gen ekspresyon farklarını test eder ve anlamlı değişimleri belirler.
- Sonuçların Görselleştirilmesi: Elde edilen bulguları görselleştirmek için Volcano plot, Heatmap gibi araçlarla verileri daha anlaşılır hale getirir.
Elde edilen diferansiyel gen ekspresyonu verilerinin yorumlanabilmesi için görselleştirme önemli bir adımdır. Volcano plot ve Heatmap gibi grafikler, farklı koşullarda ifade edilen genlerin analizini görsel olarak sunar.
Ayrıca, gene set enrichment ve pathway analysis gibi fonksiyonel analizler de yapılabilir. Bu analizler, hangi biyolojik süreçlerin veya hücresel yolların, gen ekspresyonu değişimlerinden etkilendiğini belirlemeye yardımcı olur.
Eğer diferansiyel gen ekspresyon analizi ve transkriptomik çalışmaları hakkında derinlemesine bilgi edinmek ve araştırmalarınızda kullanmak istiyorsanız, R ile Diferansiyel Gen Ekspresyonu Eğitimi size yardımcı olabilir.
Bu eğitimde DESeq2 kullanarak diferansiyel gen ekspresyon analizi yapmayı öğrenecek, analiz sonuçlarını nasıl yorumlayacağınızı ve bunları etkili bir şekilde raporlayacağınızı uygulayarak kendinizi geliştireceksiniz.
Bu eğitim, biyoteknoloji, genetik ve moleküler biyoloji alanlarında çalışan profesyoneller ve araştırmacılar için idealdir. Ayrıca, akademik kariyerini biyoinformatik üzerine inşa etmek isteyenler ve biyoteknolojik araştırmalarda veri analizi yapmak isteyen herkes için kariyerinde bir basamak olacaktır.
- Tarih: 8-9 Şubat 2025
- Eğitim Süresi: 2 gün (Cumartesi - Pazar)
- Eğitim Türü: Canlı, Çevrimiçi
- Eğitmen: Tarık KIRLIOĞLU
- Sertifika: Katılım Belgesi
- Erişim Süresi: Video kayıtları 1 yıl boyunca erişime açık olacak.
Diferansiyel gen ekspresyonu analizi yapmak ve R dilinde bu analizleri gerçekleştirmek isteyen herkes için bu eğitim önemli bir fırsat!
Eğitimin Özellikleri:
- Teorik ve Uygulamalı İçerik: Eğitim, mikrobiyom araştırmalarında kullanılan güncel biyoinformatik yöntemleri hem teorik anlatımlarla hem de interaktif uygulamalarla öğretmektedir.
- Ders Kayıtları: Canlı dersler kayıt altına alınarak 1 yıl boyunca erişiminize sunulmaktadır. Kaçırdığınız dersleri tekrar izleyebilir veya istediğiniz zaman gözden geçirebilirsiniz.
- Ödevler ve Testler: Eğitim süresince, verimliliğinizi arttırmak ve öğrendiklerinizi pekiştirmek için ödevler ve testler sunulacaktır.
Kimler İçin Uygundur?
- Biyoloji, Moleküler Biyoloji ve Genetik, Genetik ve Biyomühendislik, Tıp, Veterinerlik, Eczacılık ve Ziraat Fakültelerinde çalışan akademisyenler, sektör profesyonelleri, mezunlar ve öğrenciler.
- Araştırmalarını ve yayınlarını uluslararası standartlara uyumlu hale getirmek isteyenler.
- Akademik ve profesyonel kariyerini ilerletmek isteyen araştırmacılar.
Eğitim Gereklilikleri:
- Temel moleküler biyoloji bilgisi.
- Temel biyoinformatik kavramlarına hakimiyet önerilir.
- Daha önce biyoinformatik eğitimi almış olmak avantaj sağlayacaktır.
Tavsiye Edilen Eğitimler:
Katılım Rahatlığı:
Bu eğitime, bulunduğunuz her yerden canlı olarak katılabilirsiniz.
Hemen Yerinizi Ayırtın!
Siz de mikrobiyom araştırmalarında fark yaratmak, uluslararası standartlara uygun analizler yapmak ve kariyerinizi bir adım öteye taşımak için bu eğitime katılabilirsiniz.
📌 Kontenjan sınırlı!
📅 Kayıt olmak için hemen tıklayın.
Şimdi harekete geçin ve geleceğinizi şekillendirin! 🎯
